El 24 de agosto de 2016 fue sancionada la Ley Estatutaria 1806 de 2016, que regulaba los términos del plebiscito para la refrendación del Acuerdo Final. Cuatro días después, el Gobierno nacional expediría el Decreto 1391, por medio del cual se convocaba a la sociedad colombiana el día 2 de octubre del 2016 para pronunciarse a favor o en contra del acuerdo alcanzado en La Habana. Una vez se expidió dicho decreto, se activaron las campañas a favor y en contra a través de los diferentes comités organizadores que se desplegaron por todo el país. Los resultados del plebiscito realizado el 2 de octubre de 2016 expresaron la desaprobación del Acuerdo Final por parte de la mayoría de los votantes: 50.21 % de los votantes estuvieron en contra del Acuerdo y 49.78% lo aprobaron.